Opción 1:

Inicia la consola y ejecuta lo siguiente:

db.version()

Opción 2:

Abre una consola de shell y haz lo siguiente:

$ mongod --version

Te mostrará algo como:

$ mongod --version
Versión de la base de datos v3.0.2

Para verificar la versión de MongoDB, use el comando mongod con la opción --version.

Para comprobar la versión del Servidor de MongoDB, abra la línea de comandos a través de su programa de terminal y ejecute el siguiente comando:

Ruta: C:\Program Files\MongoDB\Server\3.2\bin
Abrir Cmd y ejecutar el siguiente comando:
mongod --version
Para verificar la versión de MongoDB Shell:
mongo --version

mongo --version

Versión de la shell de MongoDB: 2.6.10

mongod --version

Versión de la base de datos v2.6.10

mongo

Versión de la shell de MongoDB: 2.6.10
Conectando a: test

db.version()

2.6.10

Desde la API de Java:

Document result = mongoDatabase.runCommand(new Document("buildInfo", 1));
String version = (String) result.get("version");
List versionArray = (List) result.get("versionArray");