Hola tengo una secuencia que es la siguiente:
seq = 'ACTGATCGATTACGTATAGTAGAATTCTATCATACATATATATCGATGCGTTCAT'
lo cual, necesito cortarla en el punto G*AATTC , y me quede de esta forma.
ACTGATCGATTACGTATAGTAG + AATTCTATCATACATATATATCGATGCGTTCAT
Lo eh intentado con split() y con join(), pero no me resulta, alguien sabe otra forma.
gracias
Hola ya que python nos deja tratar los strings de muchas maneras (por ejemplo seleccionar solo un caracter o un rango del string) nos facilita este trabajo aca te dejo el codigo espero que sea de tu ayuda:
seq = 'ACTGATCGATTACGTATAGTAGAATTCTATCATACATATATATCGATGCGTTCAT'
#Aqui se definen las cadenas donde se debe cortar
corte = "G"
secuencia = "AATTC"
clen = len(corte)
slen = len(secuencia)
for i in xrange(len(seq)-clen-slen):
if seq[i:i+clen] == corte and seq[i+clen:i+clen+slen] == secuencia:
comienzo = seq[0:i+clen]
final = seq[i+clen:len(seq)]
#Aqui haces lo que quieras el encontrar donde se corta (como ejemplo yo solo hago un print)
print comienzo + " + " + final Iteramos es una comunidad de desarrolladores que busca expandir el conocimiento de la programación mas allá del inglés.
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